布鲁塞尔在公元979年由洛林的查理在塞纳河沿岸正式建立。查理是查理曼的后裔，他在一座小天主教堂和小镇周边建立了第一座永久性防御工事。最早的城市建在沿河低洼地带常常遭到洪水的侵袭，因而使他获得了一个荷兰名字“布鲁塞尔”，意指沼泽中的城市。从11世纪到14世纪，城墙在不断建设和扩张，使城市有一个相对稳定的时期来成长和扩张，而这种和平在当时的欧洲是很不常见的。

这种平静在1695年被打破，法国的路易十四派遣军队攻击布鲁塞尔，用大炮轰击这座城市，摧毁了大皇宫和将近三分之一的城区，使城市遭受了历史上最大的破坏。这次入侵还导致了当地的“法兰西化”，既有文化上的也有语言上的。1830年南部讲法语的省份发动起义与讲荷兰语的省份决裂，这场争端席卷了布鲁塞尔大部分地区。比利时独立之后，新的国王利奥波德一世开始大规模地拆除旧城墙为新的建筑和现代化设施的建设腾出空间。这也有助于他对森讷——城市之前的中心地区进行的改造计划，这一地区当时已经成为了一个藏污纳垢的地区。

布鲁塞尔以很小的代价在二次世界大张中幸存了下来（虽然德军不时地侵入其领土），而这很大程度上受益于其坚定不移地奉行的中立政策。正是这种中立性，使这座城市成为了现代的国际政治中心，事实上的欧盟首都以及北大西洋公约组织的总部。在和平之外的唯一争端还是在于法语和荷兰语地区之间法律管辖权上的问题，这成为整个比利时最主要的矛盾。