巴拿马共和国的首都巴拿马城濒临巴拿马湾，是巴拿马运河在太平洋一侧的终点站。“巴拿马”的意思是“很多鱼”，当西班牙征服者到达时，这里已经存在一个土著人的大型渔村。西班牙的巴拿马总督为了方便的将大西洋的货物和财富，通过巴拿马地峡运到太平洋一侧，于1519年建立了这座港口城市。它作为征服印加帝国的首要桥头堡，负责将印加的财富转运至西班牙的国库。

这座城市因转运业务而迅速富裕起来，之后一度遭到英国海盗亨利·摩根爵士的劫掠并被焚毁。三年之后，该城又在原址的南面重新建立起来。虽然此后西班牙人加固了城防，但由于1746年濒临加勒比海的港口波托韦洛被破坏，使得陆路贸易线受到严重打击，巴拿马城的财富和声望不断流失。一个世纪之后，随着巴拿马铁路的开通，前往加利福利亚的淘金者纷纷取道此处的铁路和公路穿越巴拿马地峡，再由从巴拿马城启航的船只将这场淘金热所引发的大量人流和物资运往北方。

1903年巴拿马脱离哥伦比亚宣布独立之后，巴拿马城被定为首都。1914年巴拿马运河竣工，使得这座城市迅速成为中美洲的国际商贸和旅游中心。如今的巴拿马城拥有超过八十家银行，是拉丁美洲当之无愧的最富有的城市。近年国际上掀起了对巴拿马航运业的投资浪潮，运河扩建计划也在2006年全民公投中获得通过，这一切都表明巴拿马城仍将持续焕发经济活力。